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[FRB-Cesab] Bonnes pratiques pour une recherche reproductible en écologie numérique – 2022

Gestion des versions, reproductibilité, compendium et conteneurisation

[FRB-Cesab] Bonnes pratiques pour une recherche reproductible en écologie numérique – 2022
Le CesabCentre de synthèse et d’analyse sur la biodiversité – de la FRB et le GdR EcoStat proposent la quatrième édition de la formation « Bonnes pratiques pour une recherche reproductible en écologie numérique ». Cette formation de cinq jours a pour objectif de former de jeunes chercheurs / chercheuses aux outils de reproductibilité, de développement logiciel et de gestion de versions (R, git, markdown, renv, docker, etc…) appliqués à la recherche en biodiversité.
 

Cette formation sera dispensée en français et se déroulera fin novembre 2022 (date précise à suivre) dans les locaux du Cesab à Montpellier. 

 

 

Retreouvez la formation sur GitHub

 

 

Les pré-inscriptions s’ouvriront à la fin juin 2022.

 

Liste des intervenants (par ordre alphabétique) :
  • Nicolas CASAJUS (FRB-Cesab)
  • Stéphane DRAY (CNRS LBBE)
  • Olivier GIMENEZ (CNRS Cefe)
  • Loreleï GUÉRY (Cirad Phim)
  • François GUILHAUMON (IRD Marbec)
INFORMATIONS PRATIQUES

fin novembre 2022

 

• Ouverture des pré-inscriptions

fin juin 2022

CESAB – FRB

5, rue de l’École de médecine

34000 Montpellier

 

Contact

 

Nicolas CASAJUS 

FicheMail

Pré-programme
Lundi 
  • Accueil et présentation de la semaine
  • Science ouverte et Recherche reproductible
  • Research Compendium
 
Mardi 
  • Gestion des versions et partage (git, GitHub, etc.) 
  • Programmation lettrée (Rmarkdown)
 
Mercredi 
  • Optimisation du flux de travail (target)
  • Reproductibilité avancée : conteneurisation (docker), renv et package R
 
Jeudi
  • Projets en sous-groupes
 
Vendredi
  • Projets en sous-groupes
  • Restitution des projets
co-organisateur