Accueil > Nos actions > Programmes et projets de recherche > La synthèse au Cesab > Les formations au Cesab > La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture
Nos actions
Depuis 2024
La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture
Cycle de la donnée, Principes FAIR/CARE, Métadonnées, Plan de gestion des données, Data paper
Cette formation de cinq jours, co-organisée avec le PNDB (Pôle National des Données de Biodiversité) et le GBIF France, a pour objectif de 1) contextualiser les enjeux autour de la compréhension, du partage et de la (ré)utilisation des données et métadonnées de biodiversité et 2) faire monter en compétences les communautés intervenant à une ou plusieurs étapes du cycle de la donnée.
Cette formation est dispensée en français et se déroule en novembre dans les locaux du Cesab à Montpellier. Son prix est de 250 € pour la semaine – repas du midi inclus. Les frais de transport, d’hébergement et les repas du soir sont à la charge des participant·es.
Retrouvez la formation sur GitHub
Une bonne maîtrise du logiciel R est requise.
Liste des intervenant·es :
- Anne-Sophie ARCHAMBEAU (GBIF France)
- Nicolas CASAJUS (FRB-Cesab)
- Camille COUX (FRB-Cesab)
- Yvan LE BRAS (PNDB)
- Olivier NORVEZ (Data Terra)
- Sophie PAMERLON (GBIF France)
Exemple de programme
La formation sera axée sur des cours et des exercices pendant les quatre premiers jours, avec des projets en petits groupes prévus pour le dernier jour.
Contexte général
- Défis actuels liés aux données sur la biodiversité
- L’écosystème des données
- Les concepts de reproductibilité
- Qu’est-ce que les données et les métadonnées ?
- Les principaux types de données sur la biodiversité
- Cadres et bonnes pratiques (cycle de vie des données, principes FAIR, etc.)
- Plan de gestion des données
Acquisition des données
- Bonnes pratiques pour la collecte de données
- Principales bases de données sur la biodiversité
- Principales bases de données environnementales
- Acquisition de données : portails web, API et web scraping
Gestion des données
- Structure, formats et fichiers
- Traitement et nettoyage des données
- Introduction à OpenRefine
- Environnements virtuels de recherche
Projets DataSHARE
- Les projets DataSHARE du FRB-Cesab
- Focus sur deux groupes
Aspects juridiques
- Partage, licences, etc.
Ouverture des données
- Les standards de (méta)données
- Stockage et archivage
- Diffusion et partage
- Data et software papers
CO-ORGANISATEUR
