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Projet fini en 2021 - After en 2022

Free

Causes et conséquences de la rareté fonctionnelle du local au global

Free

La crise de la biodiversité impacte en priorité les espèces rares, c’est-à-dire celles déjà menacées car leur distribution spatiale est très limitée. Les caractéristiques intrinsèques de ces espèces qui peuvent expliquer leur vulnérabilité face aux changements globaux restent mal connues malgré tout. En outre, une question se pose : quelle est la conséquence de la perte de ces espèces pour les écosystèmes et l’Humanité ? La question est loin d’être triviale dans la mesure où nous ne connaissons pas le rôle joué par les espèces rares au sein d’un écosystème. A l’inverse, nous ne savons pas qui porte des fonctions essentielles et potentiellement vulnérables au sein d’un écosystème.

 

Les premiers résultats de Free permettent de mettre en évidence que :

  • contrairement aux idées reçues, une espèce peu abondante peut jouer un rôle écologique unique et essentiel
  • les espèces rares sont déjà plus menacées par l’Homme que les espèces écologiquement communes et seront plus impactées par les changements climatiques à venir,
  • les zones du globe où la rareté fonctionnelle est la plus forte (« points chauds » de rareté fonctionnelle) diffèrent des zones où l’on trouve les espèces les plus vulnérables. Cela a des conséquences majeures pour la conservation des espèces et des écosystèmes dans la mesure où la rareté fonctionnelle semble être un critère supplémentaire à considérer en urgence pour l’établissement des listes des espèces dites à risque et pour décider de la localisation et de la taille des aires à protéger.

 

free cesab

Distribution spatiale des espèces de mammifères écologiquement rares (b) et écologiquement communes (c) (Loiseau et al., 2020)

 

FREE-CESAB-OCT-2021

Les membres du projet free au Cesab en octobre 2021

les chercheurs

Porteurs de projet :

 

Cyrille VIOLLE – CEFE-CNRS (France)

Postdoctorant :

 

Nicolas LOISEAU – CEFE-CNRS (France)

ouvrir/fermer Participants :

Adam ALGAR – University of Nottingham (UK); Arnaud AUBER – IFREMER Boulogne-sur-mer (France); Marc CADOTTE – University of Toronto, (Canada); Pierre DENELLE -CNRS (France); Brian ENQUIST – University of Arizona (USA); Noah FIERER – University of Colorado (USA); Matthias GRENIE – CNRS (France); Gaurav KANDLIKAR – University of California (USA); Christopher KLAUSMEIER – Michigan State University (USA); Nathan KRAFT, University of Maryland (USA); Sébastien LAVERGNE -Université de Grenoble (France); Helena LITCHMAN – Michigan State University (USA); Anthony MAIRE – EDF (France); Brian MAITNER – University of Arizona (USA); Camille MARTINEZ –  Grenoble University (France); Brian MCGILL – University of Maine (USA); Matthew MCLEAN – Ifremer (France); David MOUILLOT – University of Montpellier (France); Nicolas MOUQUET – CNRS Montpellier (France); François MUNOZ – Grenoble University (France); Juliette MURGIER – Ifremer (France); Annette OSTLING -University of Michigan (USA); Caroline TUCKER – University of Colorado (USA); Wilfried THUILLER – CNRS Grenoble (France); Sébastien VILLEGIER – CNRS (France); Lucie ZINGER – University of Paul Sabatier (France).

Le projet Free réunit des spécialistes en écologie des communautés, macro-écologie biogéographie, écologie fonctionnelle, écologie microbienne et phylogénie.

le projet

Le projet Free est issu de l’appel à projet de 2015. Le processus de sélection du projet a été réalisé par un comité d’experts indépendants.

publications

[27] Auber A, Waldock C, Maire A, Goberville E, Albouy C, Algar AC, McLean M, Brind'Amour A, Green AL, Tupper M, Vigliola L, Kaschner K, Kesner-Reyes K, Beger M, Tjiputra J, Toussaint A, Violle C, Mouquet N, Thuiller W & Mouillot D (2022) A functional vulnerability framework for biodiversity conservation. Nature Communications, 13, 4774. doi: 10.1038/s41467-022-32331-y.

 

[26] Brun P, Violle C, Mouillot D, Mouquet N, Enquist BJ, Munoz F, Münkemüller T, Ostling A, Zimmermann NE & Thuiller W (2022) Plant community impact on productivity: Trait diversity or key (stone) species effects? Ecology Letters, 25, 913–925. doi: 10.1111/ele.13968.

 

[25] Delalandre L, Gaüzère P, Thuiller W, Cadotte MW, Mouquet N, Mouillot D, Munoz F, Denelle P, Loiseau N, Morin X & Violle C (2022) Functionally distinct tree species support long-term productivity in extreme environments. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 289, 20211694. doi: 10.1098/rspb.2021.1694.

 

[24] Feng X, Enquist BJ, Park DS, Boyle B, Breshears DD, Gallagher RV, Lien A, Newman EA, Burger JR, Maitner BS, Merow C, Li Y, Huynh KM, Ernst K, Baldwin E, Foden W, Hannah L, Jorgensen PM, Kraft NJB, Lovett JC, Marquet PA, McGill BJ, Morueta‐Holme N, Neves DM, Núñez‐Regueiro MM, Oliveira‐Filho AT, Peet RK, Pillet M, Roehrdanz PR, Sandel B, Serra‐Diaz JM, Símová I, Svenning J, Violle C, Weitemier TD, Wiser S & López‐Hoffman L (2022) A review of the heterogeneous landscape of biodiversity databases: Opportunities and challenges for a synthesized biodiversity knowledge base. Global Ecology and Biogeography, 31, 1242–1260. doi: 10.1111/GEB.13497.

 

[23] Guo W-Y, Serra-Diaz JM, Schrodt F, Eiserhardt WL, Maitner BS, Merow C, Violle C, Anand M, Belluau M, Bruun HH, Byun C, Catford JA, Cerabolini BEL, Chacón-Madrigal E, Ciccarelli D, Cornelissen JHC, Dang-Le AT, de Frutos A, Dias AS, Giroldo AB, Guo K, Gutiérrez AG, Hattingh W, He T, Hietz P, Hough-Snee N, Jansen S, Kattge J, Klein T, Komac B, Kraft NJB, Kramer K, Lavorel S, Lusk CH, Martin AR, Mencuccini M, Michaletz ST, Minden V, Mori AS, Niinemets Ü, Onoda Y, Peñuelas J, Pillar VD, Pisek J, Robroek BJM, Schamp B, Slot M, Sosinski ÊE, Soudzilovskaia NA, Thiffault N, van Bodegom P, van der Plas F, Wright IJ, Xu W-B, Zheng J, Enquist BJ & Svenning J-C (2022) High exposure of global tree diversity to human pressure. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 119, e2026733119. doi: 10.1073/pnas.2026733119.

 

[22] Magneville C, Loiseau N, Albouy C, Casajus N, Claverie T, Escalas A, Leprieur F, Maire E, Mouillot D & Villéger S (2022) mFD: an R package to compute and illustrate the multiple facets of functional diversity. Ecography, 44, 1–15. doi: 10.1111/ecog.05904.

 

[21] Sabatini FM, Jiménez-Alfaro B, Jandt U, Chytry M, Field R, Kessler M, Lenoir J, Schrodt F, Wiser SK, Arfin Khan MAS, Attorre F, Cayuela L, De Sanctis M, Dengler J, Haider S, Hatim MZ, Indreica A, Jansen F, Pauchard A, Peet RK, Petrik P, Pillar VD, Sandel B, Schmidt M, Tang Z, van Bodegom P, Vassilev K, Violle C, Alvarez-Davila E, Davidar P, Dolezal J, Hérault B, Galán-de-Mera A, Jiménez J, Kambach S, Kepfer-Rojas S, Kreft H, Lezama F, Linares-Palomino R, Monteagudo Mendoza A, N'Dja JK, Phillips OL, Rivas-Torres G, Sklenár P, Speziale K, Strohbach BJ, Vásquez Martínez R, Wang H-F, Wesche K & Bruelheide H (2022) Global patterns of vascular plant alpha diversity. Nature Communications, 13, 4683. doi: 10.1038/s41467-022-32063-z.

 

[20] Gross N, Le Bagousse-Pinguet Y, Liancourt P, Saiz H, Violle C & Munoz F (2021) Unveiling ecological assembly rules from commonalities in trait distributions. Ecology Letters, 24, 1668–1680. doi: 10.1111/ele.13789.

 

[19] Mouillot D, Loiseau N, Grenié M, Algar AC, Allegra M, Cadotte MW, Casajus N, Denelle P, Guéguen M, Maire A, Maitner B, McGill BJ, McLean M, Mouquet N, Munoz F, Thuiller W, Villéger S, Violle C & Auber A (2021) The dimensionality and structure of species trait spaces. Ecology Letters, 24, 1988–2009. doi: 10.1111/ele.13778.

 

[18] Murgier J, McLean M, Maire A, Mouillot D, Loiseau N, Munoz F, Violle C & Auber A (2021) Rebound in functional distinctiveness following warming and reduced fishing in the North Sea. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 288, 20201600. doi: 10.1098/rspb.2020.1600.

 

[17] Sala E, Mayorga J, Bradley D, Cabral RB, Atwood TB, Auber A, Cheung W, Costello C, Ferretti F, Friedlander AM, Gaines SD, Garilao C, Goodell W, Halpern BS, Hinson A, Kaschner K, Kesner-Reyes K, Leprieur F, McGowan J, Morgan LE, Mouillot D, Palacios-Abrantes J, Possingham HP, Rechberger KD, Worm B & Lubchenco J (2021) Protecting the global ocean for biodiversity, food and climate. Nature, 592, 397–402. doi: 10.1038/s41586-021-03371-z.

 

[16] Denelle P, Violle C & Munoz F (2020) Generalist plants are more competitive and more functionally similar to each other than specialist plants: insights from network analyses. Journal of Biogeography, 47, 1922–1933. doi: 10.1111/jbi.13848.

 

[15] Grenié M, Violle C & Munoz F (2020) Is prediction of species richness from stacked species distribution models biased by habitat saturation? Ecological Indicators, 111, 105970. doi: 10.1016/j.ecolind.2019.105970.

 

[14] Laroche F, Violle C, Taudière A & Munoz F (2020) Analyzing snapshot diversity patterns with the Neutral Theory can show functional groups' effects on community assembly. Ecology, 101, e02977. doi: 10.1002/ecy.2977.

 

[13] Loiseau N, Mouquet N, Casajus N, Grenié M, Guéguen M, Maitner B, Mouillot D, Ostling A, Renaud J, Tucker C, Velez L, Thuiller W & Violle C (2020) Global distribution and conservation status of ecologically rare mammal and bird species. Nature Communications, 11, 5071. doi: 10.1038/s41467-020-18779-w.

 

[12] Mahaut L, Cheptou P-O, Fried G, Munoz F, Storkey J, Vasseur F, Violle C & Bretagnolle V (2020) Weeds: Against the rules? Trends in Plant Science, 25, 1107–1116. doi: 10.1016/j.tplants.2020.05.013.

 

[11] Mahaut L, Fort F, Violle C & Freschet GT (2020) Multiple facets of diversity effects on plant productivity: Species richness, functional diversity, species identity and intraspecific competition. Functional Ecology, 34, 287–298. doi: 10.1111/1365-2435.13473.

 

[10] Thuiller W, Gravel D, Ficetola GF, Lavergne S, Münkemüller T, Pollock LJ, Zimmermann NE & Mazel F (2020) Productivity begets less phylogenetic diversity but higher uniqueness than expected. Journal of Biogeography, 47, 44–58. doi: 10.1111/jbi.13630.

 

[09] Denelle P, Violle C & Munoz F (2019) Distinguishing the signatures of local environmental filtering and regional trait range limits in the study of trait–environment relationships. Oikos, 128, 960–971. doi: 10.1111/oik.05851.

 

[08] Enquist BJ, Feng X, Boyle B, Maitner BS, Newman EA, Jorgensen PM, Roehrdanz PR, Thiers BM, Burger JR, Corlett RT, Couvreur TLP, Dauby G, Donoghue JC, Foden W, Lovett JC, Marquet PA, Merow C, Midgley G, Morueta-Holme N, Neves DM, Oliveira-Filho AT, Kraft NJB, Park DS, Peet RK, Pillet M, Serra-Diaz JM, Sandel B, Schildhauer MP, Símová I, Violle C, Wieringa JJ, Wiser SK, Hannah L, Svenning J-C & McGill BJ (2019) The commonness of rarity: Global and future distribution of rarity across land plants. Science Advances, 5, eaaz0414. doi: 10.1126/sciadv.aaz0414.

 

[07] McLean M, Auber A, Graham NAJ, Houk P, Villéger S, Violle C, Thuiller W, Wilson SK & Mouillot D (2019) Trait structure and redundancy determine sensitivity to disturbance in marine fish communities. Global Change Biology, 25, 3424–3437. doi: 10.1111/gcb.14662.

 

[06] Echeverría-Londoño S, Enquist BJ, Neves DM, Violle C, Boyle B, Kraft NJB, Maitner BS, McGill BJ, Peet RK, Sandel B, Smith SA, Svenning J-C, Wiser SK & Kerkhoff AJ (2018) Plant functional diversity and the biogeography of biomes in North and South America. Frontiers in Ecology and Evolution, 6, 219. doi: 10.3389/fevo.2018.00219.

 

[05] Grenié M, Mouillot D, Villéger S, Denelle P, Tucker CM, Munoz F & Violle C (2018) Functional rarity of coral reef fishes at the global scale: Hotspots and challenges for conservation. Biological Conservation, 226, 288–299. doi: 10.1016/j.biocon.2018.08.011.

 

[04] Blonder B, Morrow CB, Maitner BS, Harris DJ, Lamanna C, Violle C, Enquist BJ & Kerkhoff AJ (2017) New approaches for delineating n-dimensional hypervolumes. Methods in Ecology and Evolution, 9, 305–319. doi: 10.1111/2041-210X.12865.

 

[03] Grenié M, Denelle P, Tucker CM, Munoz F & Violle C (2017) funrar: An R package to characterize functional rarity. Diversity and Distributions, 23, 1365–1371. doi: 10.1111/ddi.12629.

 

[02] Violle C, Thuiller W, Mouquet N, Munoz F, Kraft NJB, Cadotte MW, Livingstone SW, Grenié M & Mouillot D (2017) A common toolbox to understand, monitor or manage rarity? A response to Carmona et al. Trends in Ecology & Evolution, 32, 891–893. doi: 10.1016/j.tree.2017.10.001.

 

[01] Violle C, Thuiller W, Mouquet N, Munoz F, Kraft NJB, Cadotte MW, Livingstone SW & Mouillot D (2017) Functional rarity: The ecology of outliers. Trends in Ecology & Evolution, 32, 356–367. doi: 10.1016/j.tree.2017.02.002.

 

Free dans la presse

Auber A, Waldock C, Maire A, Goberville E, Albouy C, Algar AC, McLean M, Brind’Amour A, Green AL, Tupper M, Vigliola L, Kaschner K, Kesner-Reyes K, Beger M, Tjiputra J, Toussaint A, Violle C, Mouquet N, Thuiller W & Mouillot D (2022) A functional vulnerability framework for biodiversity conservation. Nature Communications13, 4774. doi: 10.1038/s41467-022-32331-y.

 

Sala E, Mayorga J, Bradley D, Cabral RB, Atwood TB, Auber A, Cheung W, Costello C, Ferretti F, Friedlander AM, Gaines SD, Garilao C, Goodell W, Halpern BS, Hinson A, Kaschner K, Kesner-Reyes K, Leprieur F, McGowan J, Morgan LE, Mouillot D, Palacios-Abrantes J, Possingham HP, Rechberger KD, Worm B & Lubchenco J (2021) Protecting the global ocean for biodiversity, food and climate. Nature, accepted. doi: 10.1038/s41586-021-03371-z.

 

Loiseau, N., Mouquet, N., Casajus, N. et al. Global distribution and conservation status of ecologically rare mammal and bird species. Nat Commun 11, 5071 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-18779-w

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