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[FRB-Cesab] La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture – 2025
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novembre 2025 I Formation I Cesab I Autres sujets
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[FRB-Cesab] La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture – 2025
Cette formation de cinq jours a pour objectif de travailler autour des différentes étapes du cycle de la donnée, de l’acquisition à l’ouverture en passant par la gestion, le stockage et la rédaction de data papers.
Les pré-inscriptions sont désormais ouvertes ! Pour vous pré-inscrire, remplissez le formulaire en fin de page. Attention, le nombre de places étant limité, les candidatures retenues seront confirmées en juin.
Le Cesab – Centre de synthèse et d’analyse sur la biodiversité – de la FRB, le Pôle National des Données de Biodiversité (PNDB) et GBIF France proposent la seconde édition de la formation « La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture ». Cette formation de cinq jours a pour objectif de : 1) contextualiser les enjeux autour de la compréhension, du partage et de la (ré)utilisation des données et métadonnées de biodiversité et 2) faire monter en compétences les communautés intervenant à une ou plusieurs étapes du cycle de la donnée.
Cette formation sera dispensée en français et se déroulera du 3 au 7 novembre 2025 dans les locaux du Cesab à Montpellier. Son prix est de 250 € pour la semaine – repas du midi inclus. Les frais de transport, d’hébergement et les repas du soir sont à la charge des participant(e)s.
La FRB propose 4 bourses de 250 € qui couvriront l’intégralité des frais d’inscription. Ces bourses sont destinées à soutenir les personnes ne bénéficiant d’aucun appui institutionnel (par exemple, financement de leur laboratoire, équipe de recherche, etc.) et qui ne sont pas en mesure de couvrir les frais d’inscription sur leurs fonds propres. Nous faisons pleinement confiance à chaque candidat pour évaluer sa situation et solliciter une bourse uniquement si cela s’avère nécessaire. La sélection des participants sera réalisée indépendamment des demandes de bourse. Une fois cette sélection effectuée, les bourses seront attribuées par tirage au sort parmi les personnes sélectionnées ayant exprimé un besoin d’aide financière.
Retrouvez la formation sur GitHub
Une bonne maîtrise du logiciel R est requise
Liste des organisateur.ice.s (par ordre alphabétique) :
- Anne-Sophie ARCHAMBEAU (GBIF France)
- Nicolas CASAJUS (FRB-Cesab)
- Camille COUX (FRB-Cesab)
- Yvan LE BRAS (PNDB)
- Olivier NORVEZ (PNDB)
- Sophie PAMERLON (GBIF France)
Pré-programme
Des cours magistraux suivis de travaux dirigés seront dispensés les quatre premiers jours.
Introduction et tour d’horizon
Introduction et tour d’horizon
- Défis actuels en matière de données sur la biodiversité
- L’écosystème de la donnée en France et en recherche
- Concepts de reproductibilité
- Qu’est-ce qu’une donnée/métadonnée ?
- Grands types de données
- Cadres et bonnes pratiques (cycle des données, FAIR, etc.)
- Bonnes pratiques pour la collecte de données
- Principales bases de données
- Accès aux données (API, web scraping, text mining, etc.)
- Données brutes vs. données dérivées
- Structure, formats et fichiers
- Traitement, nettoyage et homogénéisation
- Tutoriel OpenRefine
- Partage, licences, etc.
- Plan de gestion des données
- (Méta)données : les standards
- Stockage et archivage
- Diffusion et partage
- Valorisation : Data paper et Software paper
Pré-inscription
CO-ORGANISATEUR
