SpeciationDB
Création d’une base de données open-access sur la spéciation à l’échelle de l’arbre du vivant
Comprendre les mécanismes à l’origine de la formation et de la persistance des espèces constitue un enjeu majeur en sciences de la biodiversité. Si de nombreuses études ont quantifié l’isolement reproductif chez une grande diversité d’organismes, ces données demeurent fragmentées et difficiles à comparer entre taxons.
Le projet FRB-Cesab SpeciationDB vise à développer la première base de données ouverte, standardisée et évolutive d’estimations empiriques d’isolement reproductif à l’échelle de l’arbre du vivant. Le projet s’appuiera sur quatre années de travail collaboratif au sein du réseau Integration of Speciation (IoS) financé par l’ESEB, incluant une base pilote testée sur 50 études et une nouvelle ontologie de l’isolement reproductif (RIO), cadre indépendant du taxon pour classifier et harmoniser les mesures d’isolement reproductif. SpeciationDB permettra de compiler, structurer et harmoniser ces données hétérogènes dans un cadre commun. En intégrant également des métadonnées écologiques, géographiques et génomiques, SpeciationDB rendra possibles des analyses comparatives à grande échelle pour identifier les principaux déterminants de la diversification des espèces.
Cette infrastructure constituera une ressource de référence pour la communauté scientifique et les acteurs de la conservation, et contribuera à orienter les futures collectes de données et à promouvoir des standards de production et de partage.
Crédits | Photographie par Sophie Webster
Porteurs de projet
Joana MEIER – Wellcome Sanger Institute and University of Cambridge (UK)
Carole SMADJA – CNRS (France)
Le projet SpeciationDB rassemble des experts sur la spéciation, dotés de compétences variées et complémentaires couvrant diverses approches (micro- et macroévolution, approches comparatives, de terrain, expérimentales et théoriques), différents types de données (phénotypiques, comportementales, génomiques, écologiques) et divers groupes taxonomiques.
Le projet SpeciationDB est issu de l’appel à projet Ideashare et Datashare de 2025. Le processus de sélection du projet a été réalisé par un comité d’experts indépendants.