La création de la Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité s’accompagne d’un renforcement des relations entre la FRB et les ministères concernés - Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche (MESR), le Ministère de l’Ecologie, de l’Energie, du Développement Durable et de la Mer (MEEDDM) et le Minisitère de l'Alimentation, de l'Agriculture et de la Pêche (MAAP).

Par ces conventions, la FRB affiche sa volonté de tisser des liens forts avec les ministères clés dans le domaine de la biodiversité, afin de participer activement à la promotion de la recherche, ainsi qu’à la diffusion des connaissances.